Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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