Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc10P31257 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms