Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms