Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms