Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprmP28828 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprmP28828 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprmP28828 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprmP28828 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprmP28828 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprmP28828 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprmP28828 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprmP28828 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprmP28828 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprmP28828 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprmP28828 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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