Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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Hoxd10P28359 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd10P28359 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Hoxd10P28359 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd10P28359 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd10P28359 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd10P28359 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd10P28359 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd10P28359 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd10P28359 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd10P28359 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd10P28359 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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Hoxd10P28359 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd10P28359 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd10P28359 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd10P28359 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd10P28359 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd10P28359 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Hoxd10P28359 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Hoxd10P28359 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Hoxd10P28359 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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Hoxd10P28359 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd10P28359 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd10P28359 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd10P28359 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd10P28359 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd10P28359 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd10P28359 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd10P28359 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd10P28359 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd10P28359 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd10P28359 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd10P28359 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd10P28359 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd10P28359 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd10P28359 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd10P28359 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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