Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms