Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms