Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PparaP23204 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PparaP23204 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PparaP23204 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PparaP23204 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PparaP23204 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PparaP23204 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PparaP23204 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PparaP23204 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PparaP23204 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PparaP23204 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PparaP23204 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PparaP23204 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PparaP23204 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PparaP23204 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PparaP23204 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PparaP23204 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PparaP23204 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PparaP23204 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PparaP23204 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms