Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RarbP22605 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RarbP22605 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RarbP22605 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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