Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3P21107 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms