Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms