Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VimP20152 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
VimP20152 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
VimP20152 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
VimP20152 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
VimP20152 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VimP20152 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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