Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms