Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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