Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd5P13379 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd5P13379 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd5P13379 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms