Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FosbP13346 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FosbP13346 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FosbP13346 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FosbP13346 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FosbP13346 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FosbP13346 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FosbP13346 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FosbP13346 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FosbP13346 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FosbP13346 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FosbP13346 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FosbP13346 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FosbP13346 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FosbP13346 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FosbP13346 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FosbP13346 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FosbP13346 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FosbP13346 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FosbP13346 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FosbP13346 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FosbP13346 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FosbP13346 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FosbP13346 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FosbP13346 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FosbP13346 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FosbP13346 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FosbP13346 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FosbP13346 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FosbP13346 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FosbP13346 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FosbP13346 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FosbP13346 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FosbP13346 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FosbP13346 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FosbP13346 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FosbP13346 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FosbP13346 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FosbP13346 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FosbP13346 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FosbP13346 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FosbP13346 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FosbP13346 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FosbP13346 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FosbP13346 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FosbP13346 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FosbP13346 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FosbP13346 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FosbP13346 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FosbP13346 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FosbP13346 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FosbP13346 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FosbP13346 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FosbP13346 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FosbP13346 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms