Protein–RNA interactions for Protein: P08923

Ltk, Leukocyte tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtkP08923 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtkP08923 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtkP08923 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtkP08923 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtkP08923 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtkP08923 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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LtkP08923 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtkP08923 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtkP08923 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtkP08923 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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LtkP08923 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtkP08923 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtkP08923 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtkP08923 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtkP08923 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtkP08923 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtkP08923 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtkP08923 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LtkP08923 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtkP08923 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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LtkP08923 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtkP08923 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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LtkP08923 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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LtkP08923 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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LtkP08923 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtkP08923 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtkP08923 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtkP08923 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtkP08923 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtkP08923 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LtkP08923 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtkP08923 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtkP08923 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtkP08923 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtkP08923 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtkP08923 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtkP08923 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtkP08923 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtkP08923 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtkP08923 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtkP08923 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtkP08923 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtkP08923 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtkP08923 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LtkP08923 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LtkP08923 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtkP08923 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtkP08923 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtkP08923 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtkP08923 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtkP08923 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtkP08923 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtkP08923 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtkP08923 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms