Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Tgfb1P04202 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgfb1P04202 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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