Protein–RNA interactions for Protein: P01837

Ig kappa chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01837 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01837 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01837 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01837 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01837 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01837 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01837 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01837 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01837 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01837 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01837 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01837 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01837 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01837 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01837 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01837 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01837 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01837 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P01837 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01837 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01837 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P01837 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01837 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01837 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01837 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01837 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01837 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01837 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01837 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01837 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01837 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01837 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01837 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01837 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01837 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01837 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01837 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01837 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01837 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01837 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01837 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01837 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01837 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01837 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01837 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01837 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01837 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms