Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01678 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P01678 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P01678 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P01678 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P01678 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P01678 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01678 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01678 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01678 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01678 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01678 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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P01678 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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P01678 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P01678 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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P01678 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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P01678 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01678 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01678 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01678 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01678 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01678 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01678 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01678 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01678 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01678 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P01678 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01678 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01678 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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P01678 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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P01678 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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P01678 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01678 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01678 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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P01678 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01678 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01678 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01678 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01678 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01678 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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P01678 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P01678 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01678 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01678 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01678 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01678 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01678 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01678 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01678 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01678 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01678 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01678 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01678 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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