Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms