Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms