Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptpn20O55082 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms