Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SlkO54988 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlkO54988 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlkO54988 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlkO54988 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlkO54988 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlkO54988 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlkO54988 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlkO54988 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlkO54988 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlkO54988 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlkO54988 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SlkO54988 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlkO54988 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlkO54988 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlkO54988 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlkO54988 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlkO54988 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SlkO54988 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SlkO54988 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlkO54988 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlkO54988 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlkO54988 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlkO54988 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlkO54988 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlkO54988 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlkO54988 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlkO54988 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlkO54988 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlkO54988 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlkO54988 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlkO54988 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SlkO54988 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SlkO54988 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlkO54988 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlkO54988 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlkO54988 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlkO54988 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlkO54988 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlkO54988 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlkO54988 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlkO54988 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlkO54988 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlkO54988 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlkO54988 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlkO54988 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlkO54988 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlkO54988 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlkO54988 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlkO54988 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlkO54988 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlkO54988 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlkO54988 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlkO54988 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlkO54988 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlkO54988 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlkO54988 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlkO54988 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SlkO54988 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms