Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
E2f6O54917 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms