Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CrxO54751 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CrxO54751 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CrxO54751 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CrxO54751 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CrxO54751 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CrxO54751 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CrxO54751 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CrxO54751 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CrxO54751 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CrxO54751 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CrxO54751 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CrxO54751 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CrxO54751 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CrxO54751 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CrxO54751 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CrxO54751 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CrxO54751 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CrxO54751 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CrxO54751 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CrxO54751 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CrxO54751 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CrxO54751 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CrxO54751 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CrxO54751 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CrxO54751 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CrxO54751 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CrxO54751 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CrxO54751 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CrxO54751 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CrxO54751 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CrxO54751 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CrxO54751 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CrxO54751 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CrxO54751 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CrxO54751 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CrxO54751 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CrxO54751 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CrxO54751 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CrxO54751 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CrxO54751 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CrxO54751 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CrxO54751 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CrxO54751 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms