Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cavin1O54724 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cavin1O54724 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms