Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Abcc1O35379 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Abcc1O35379 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
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Abcc1O35379 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Abcc1O35379 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Abcc1O35379 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Abcc1O35379 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Abcc1O35379 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Abcc1O35379 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Abcc1O35379 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Abcc1O35379 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Abcc1O35379 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Abcc1O35379 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms