Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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H2-Q1O19441 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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H2-Q1O19441 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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H2-Q1O19441 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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H2-Q1O19441 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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H2-Q1O19441 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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H2-Q1O19441 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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H2-Q1O19441 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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H2-Q1O19441 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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H2-Q1O19441 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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