Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

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Length 174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PbsnO08976 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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PbsnO08976 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PbsnO08976 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PbsnO08976 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PbsnO08976 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PbsnO08976 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PbsnO08976 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PbsnO08976 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PbsnO08976 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PbsnO08976 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PbsnO08976 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PbsnO08976 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PbsnO08976 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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