Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms