Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms