Protein–RNA interactions for Protein: L7N479

Tcrg-C3, T cell receptor gamma, constant 3, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-C3L7N479 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tcrg-C3L7N479 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms