Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20939L7N243 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms