Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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