Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms