Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm5849J3QPE5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm5849J3QPE5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm5849J3QPE5 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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