Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Gm8356J3QPD3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8356J3QPD3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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