Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms