Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21976J3QNN2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms