Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
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Taf4bG5E8Z2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Taf4bG5E8Z2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Taf4bG5E8Z2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms