Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sclt1G5E861 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sclt1G5E861 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sclt1G5E861 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sclt1G5E861 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sclt1G5E861 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sclt1G5E861 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sclt1G5E861 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sclt1G5E861 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sclt1G5E861 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sclt1G5E861 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sclt1G5E861 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Sclt1G5E861 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sclt1G5E861 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sclt1G5E861 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Sclt1G5E861 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sclt1G5E861 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sclt1G5E861 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms