Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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