Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn5F6UCX4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms