Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28305F6U473 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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