Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms