Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Urb2E9Q7L1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms