Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ddx60E9PZQ1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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Ddx60E9PZQ1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Ddx60E9PZQ1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Ddx60E9PZQ1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ddx60E9PZQ1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ddx60E9PZQ1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ddx60E9PZQ1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Ddx60E9PZQ1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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