Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms